一、克隆氏病的手术治疗
既往多数学者主张，应尽可能不手术治疗，因手术治疗不能根治克隆氏病，除非有严重并发症时才考虑外科手术。近年来有学者认为约90%克隆病患者最终需手术治疗即使手术困难也不应拖延。很多问题是延误手术造成的，故应采取更积极的态度，一旦出现白细胞升高和长期弛张热，即应紧急手术。
1、手术适应征（1）急慢性肠梗阻；（2）肠穿孔致腹膜炎或腹腔内脓肿；（3）肠内瘘或腹壁外瘘；（4）大出血；（5）急性肠扩张（无论有无穿孔）；（6）疑有恶性变或结核；（7）内科治疗效果不佳，长期贫血、低蛋白血症及生长迟缓。
2、 手术方式 克隆病术式一般有3种；（1）短路手术；（2）短路及旷置术（3）病变肠管切除。单纯短路手术仅用于个别不能耐受的重症患者保证安全。短路及旷置手术适用于不能耐受或不宜行肠切除的患者，可使病变肠段得到休息，缓解病情，但不能痊愈。长期旷置仍有继续发展或癌变可能。此类患者作结肠镜随访时应包括旷置肠段，以免遗漏癌变，病情好转后可行二期手术。病变肠管切除及肠吻合术疗效最好，应尽可能采用。切除时应包括病灶两端5-10cm以上的正常肠段。
克隆病急性穿孔并发弥散性腹膜炎或大出血者，切除病变外，还应将局部肿胀的肠系膜淋巴一并切除。小肠的多发性病变切除时如病变较邻近，可做整段切除。否则应分段切除病变，以尽可能保留足够长的小肠，避免发生术后短肠综合征。一般切除50%左右的小肠，患者术后仍可耐受。大肠克隆病的手术处理应依据病变范围而定。局限性病变可行结肠节段性切除或直肠切除。结肠直肠均受累时则应行全大肠切除回肠造口术。当误诊为阑尾炎而剖腹探查时，是否切除阑尾尚有争议。一般认为，如回盲部未受克隆病侵犯则可切除阑尾，将不会导致术后肠瘘的发生。对于克隆氏病术中发现的病变往往比术前估计的要大。在这两种情况下，必须检查全部小肠，以发现可能存在的其它病变。即使已诊断为溃疡性结肠炎，也应仔细检查小肠，因为邻近肠管偶可发现与克隆氏病一致的病变。显然，这种情况下就要求术者行不同的手术。
二、溃结的手术治疗
约50%的重度溃结或顽固性溃结需手术治疗，溃结对手术治疗反应良好，全大肠切除术可根治溃结。
1、手术适应征（1）全结肠病变的重型患者经内科长期治疗无效者；（2）慢性患者缓解期甚短，伴有全身情况逐渐衰弱者；（3）出现严重局部或全身并发症，如严重急性感染、中毒性巨结肠、结肠穿孔和大量出血、梗阻、恶变、息肉或瘘管形成，肠管纤维化失去正常功能至持续腹泻、关节炎等。到目前为止，难治性溃疡性结肠炎是外科治疗最常见的适应征。这些病人的病变范围通常包括全部或次全部的结肠。即使那些病变范围较小的病人也应选择手术，特别是老年患者（年龄超过60岁）。这些病人长期忍受肠道疾病的痛苦，有人曾经讲过一个长期痛苦的患者足已“认可”回肠造口术---也就是说他已经从生理和心理上接受了外科手术。
2、 手术方式的选择 溃疡性结肠炎的外科治疗有五个基本的手术操作方式：(1)直肠结肠切除及回肠造瘘术；(2)全部分或大部分结肠切除而保留直肠（回肠直肠吻合、黏膜造瘘或关闭直肠残端），(3)全部直肠结肠切除，回肠肛门吻合；(4)结肠直肠切除及带贮袋的回肠造瘘术（Kock）；(5）全部直肠结肠切除、回肠肛门吻合及合并回肠贮袋（Parks,Utsunomiya,Fonkalsrud,Peck）。对于中毒性巨结肠患者，第六种选择术式是反向的袢式回肠造瘘合并用于减压的皮肤水平（排泄孔）结肠造口术。
进行溃疡性结肠手术前就应有既定手术方案，也就是说，无论术中有何发现，均应做全结肠切除。不管医生想做多么高深的手术，都应在术前有个计划，可通过病史、内镜和放射线检查进行术前评估---而不能依据术中发现---去决定溃疡性结肠炎手术的切除范围。
三、手术治疗的疗效及预后
在上述的五个基本手术操作中，以第一种术式最为实用，手术风险小，术后并发症少，疗效彻底，对溃疡性结肠炎的治愈率可达100%，但因需行回肠造瘘术影响病人的术后生活质量，所以大部分病人不愿意接受此手术。而作为临床医生应尽量劝说病人行此手术。以保证术后的疗效又减少并发症，降低危险性。第二种术式为姑息性手术，适合年龄较大，体质较差，承受不了腹、会阴联合手术的病人。但如保留直肠、行回肠直肠吻合术，所保留直肠的炎症复发率、癌变率均很高；如行黏膜造瘘关闭直肠残端，将其旷置，其癌变率会更高。虽病人易接受，但临床中应有选择性的应用。第三种术式病人虽能够暂时性接受，但远期的生活质量低，每天排便十几次甚至几十次，使病人痛苦不堪，故不如回肠造瘘术更容易护理。第四种术式根据现有的造口技术及造口护理用品，已没有必要应用，而且它也具有一定的并发症。第五种术式为最理想、患者最易接受的一种手术，疗效彻底，术后生活质量较高，但因其手术难度大，术后并发症多，医生及医院都承担相当大的风险，在临床中不容易广泛应用。
目前，直肠结肠切除并回肠造瘘术的并发症和死亡率很低。Marroudist和 Schrock报道110例经腹全结肠切除、直肠切除或两者都切除的患者中手术的死亡率为2%。
Goligher的经验表明，113例克隆氏病患者试行直肠结肠切除并回肠造瘘术后死亡10例，死亡率为9%。504例溃疡性结肠炎患者术后死亡34例，死亡率为6.7%。择期手术，限期手术和急诊手术的死亡率分别为3%、10.7%和近25%。其它报道也提示该手术死亡率在7%-10%。
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